بهینه سازی روش فنول کلروفرم سیلیکا برای استخراج dna از نمونه استخوان های قدیمی
نویسندگان
چکیده
مقدمه: استخراج dna از نمونه استخوان های قدیمی همواره با مشکلات زیادی همراه است. روش فنول کلروفرم سیلیکا یکی از روش هائی است که به طور معمول برای این منظور استفاده می شود. در این مطالعه هدف بررسی و بهینه سازی مراحل این روش است. مواد و روش ها: dna 62 نمونه استخوان (دارای عمر 3 تا 11 سال) ابتدا با روش فنول کلروفرم معمولی و سپس با تغییر بعضی پارامترها استخراج شد . dna حاصل در هشت منطقه str به نام های cd4, vwa, lpl, d5s818, d16s539, d13s317, f13, fes توسط واکنش pcr تکثیر شد و نتایج حاصل برروی ژل اکریلامید مقایسه شد. نتایج: میانگین بازدهی واکنش pcr ، برای روش جدید و روش معمولی در هشت منطقه پلی مورفیک ذکر شده به ترتیب 75%، 78%، 81%، 76%، 85%، 71%، 89%، 86%و 64%، 39%، 70%، 49%، 68%، 76%، 71%، 28% بود. متوسط میزان dna حاصل از روش بهینه شده (در غلظت µl 35 ذرات سیلیکا) و معمولی به ترتیب برابر µg/ml 5/267 با خلوص 12/1 و µg/ml 76/192 با خلوص 84/0 بود. نتیجه گیری: طبق یافته های این مطالعه به نظر می رسد تیمار طولانی تر با edta یکی از عوامل مؤثر حذف بهتر کلسیم باشد و همچنین غلظت مناسب ذرات محلول سیلیکا می تواند تأثیر مهمی در حذف مهار کننده های pcr داشته باشد.
منابع مشابه
بهینه سازی روش استخراج DNAاز استخوان برای به دست آوردن ماده ژنتیکی از استخوان و دندان های باستانی
زمینه و هدف: واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) یکی از مهمترین ابزارهای تشخیصی ملکولی مدرن میباشد که ما را قادر میسازد تا به بررسی ابعاد مختلف ملکولی یک یاخته بپردازیم. از اصلیترین اجزاء آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز، DNA میباشد که با استفاده از آن و تکثیر بخشهای اختصاصی آن قادر خواهیم بود تا ابعاد مختلف حیاتی یک یاخته را مورد بررسی قرار دهیم. در این مطالعه ما با استفاده از بررسی گروهی از نمو...
متن کاملمقایسه کارایی روش استخراجی فنل کلروفرم سیلیکا با روش گوانیدین تیوسیانات سیلیکا در بازیابی DNA از بقایای اسکلتی
زمینه و هدف: تست های DNA Typing نقش بسیار مهمی در تعیین هویت اجساد و شناسایی قربانیان بلایای دسته جمعی و اجساد سربازان جنگی دارند. به دست آوردن DNA با وزن مولکولی مناسب برای انجام آزمایشات DNA Typing در اجساد سوخته، اجسادی که مدتی طولانی از مرگ آنها گذشته یا مدتی در آب غوطه ور بوده اند به علت تجزیه DNA با مشکلات زیادی همراه می باشد. هدف از این بررسی، مقایسه و ارزیابی دو روش استخراجی مختلف به ...
متن کاملمقایسه استخراج DNA به دو روش Chelex و فنل کلروفرم از بلوک های پارافینی سرطانی
زمینه و هدف: بررسی تغییرات ژنتیکی در سرطان ها از دید مولکولی جهت تشخیص، پیگیری و درمان، لازم و ضروری است. برای انجام کارهای مولکولی اولین قدم استخراج DNA است. به کارگیری روش های عملی آسان و ارزان که بتواند استخراج DNA را برای کارهای مولکولی آسان تر کند، مفید خواهد بود معمولا پس از جراحی، نمونه های سرطانی به طور روتین در فرمالین ثابت و در پارافین قالب گیری می شوند و استخراج DNA با کیفیت مناسب از...
متن کاملبهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp
مقاله حاضر به ارائه روشی ساده جهت استخراج DNA ژنومی از گیاهان دارای متابولیتهای ثانویه زیاد می پردازد. در این روش برگهای جوان و برگهای نسبتاً مسن از گونه های مختلف بادام وحشی و نیز ارقام اهلی، به عنوان مواد گیاهی، مورد بررسی قرار گرفتند. دراین روش ازSDS به جای CTAB که عمدتاً برای استخراج DNAگیاهان حاوی پلی ساکارید زیاد بکارمیرود و نیز سارکوسیل که دارای هزینه نسبتاً بالایی می باشند، نمک NaCI با غلظ...
متن کاملبهینه سازی استخراج DNA ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل
Background & Objectives: Today, major progress has been made in molecular experiments. The first step towards improving these experiments is the accurate extraction of nucleic acid. In this study, a protocol for DNA extraction was proposed in accordance with silica gel method. DNA purification, developed based on the silica-gel-membrane technology, is a simple method, which involves three s...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
دانش و تندرستیجلد ۹، شماره ۲، صفحات ۰-۰
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023